噬菌体免疫沉淀测序技术(Phage Immunoprecipitation Sequencing,PhIP-seq)近年来迅速崛起,成为高通量筛选中的重要工具。该技术结合了高容量的噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀和高通量测序,能够对抗原-抗体匹配进行全局、系统性的抗体库分析。这种技术具有高灵敏度,能够高效检测抗体与多肽的结合,同时通过研究结合位点,深入解析抗体与靶标之间的作用机制。噬菌体免疫沉淀测序技术广泛应用于自身抗体组的研究、感染性疾病相关抗体的发现及疫苗研发等领域,为复杂的免疫学问题提供了有力的解决方案,在生物医学研究中展现出重要的应用价值。
最近,来自荷兰格罗宁根大学的研究团队在顶尖免疫学期刊《Immunity》上发表了两篇相关论文,利用噬菌体免疫沉淀检测技术深度构建和分析了人血清的抗体库,并发现了炎症性肠病(IBD)的特征抗体标志物。这两篇论文使用了相同的噬菌体展示肽库,筛选了超过1000个血清样本,从不同角度进行了深入探讨。该噬菌体展示肽库包含344,000条多肽,它们的来源包括微生物(如肠道微生物、益生菌和致病菌)、致病因子数据库(VFDB)及免疫表位数据库(IEDB),每条肽的长度为64个氨基酸,且相邻肽之间有20个氨基酸的重叠。
第一篇文章专注于炎症性肠病(包括克罗恩病CD和溃疡性结肠炎UC)患者的抗体组分析。研究团队采用高通量噬菌体展示免疫沉淀测序技术,分析了497例IBD患者与1326名对照者的血清抗体。对比分析显示,炎症性肠病患者的抗体表位谱与健康对照组显著不同,识别了373种IBD差异表达的抗体反应,其中包含202种过度表达和171种低表达。这些多肽间存在一定的共线性,提示它们可能共享相似的抗体识别基序或结构域。
此外,研究还评估了这些多肽与患者临床特征的相关性,发现一些多肽与疾病活动度、炎症指标及并发症显著相关,这些抗体可能源于发病前的遗传易感性,而在疾病发生后被激活或重新定向。接着,研究团队选取了少量差异化的肽段,运用递归特征消除(RFE)方法建立并优化模型,以区分IBD患者和对照组。结果表明,抗体表位谱能够有效地区分克罗恩病患者(AUC=0.89),即便仅使用10个特异性抗体也能够相对准确地区分(AUC=0.87),这表明这些特异多肽可作为IBD诊断的潜在标志物。
通过对抗体表位谱的分析,不同的组别得以进行分类,这项研究为未来的IBD诊断和治疗策略提供了新的思路与方法。随着生物医学领域的不断发展,环亚集团ag旗舰厅将持续关注并推动相关技术的应用和研究,助力医疗健康的创新发展。